El Programa de Fruticultura trabaja en diferentes ejes de investigación orientados a la mejora de la producción frutícola del litoral Ecuatoriano y a la búsqueda de soluciones a los factores limitantes para lograr una producción sostenible y eficiente, abordando la prospección, conservación, caracterización, evaluación y mejora del material vegetal local y la optimización del sistema de producción. Además, se trabaja en la prospección y evaluación de materiales locales, con la selección y conservación de germoplasmas prioritarios para la liberación de especies frutícolas como: marañón, tamarindo, mango, cítricos, vid, maracuyá y especies en peligro de extinción, con miras a obtener variedades adaptadas a diferentes zonas agroecológicas con alto potencial de rendimiento, calidad, adecuada época de cosecha y niveles de resistencia a plagas y enfermedades, con el objetivo de posibilitar una diversificación productiva frutícola en la región.

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