En línea con los objetivos institucionales del INIAP, el DENAREF se encarga de la conservación y uso de la agrobiodiversidad Ecuatoriana. Sus objetivos específicos son los siguientes: Conservar la agrobiodiversidad de los cultivos nativos y sus especies silvestres relacionadas, a través de técnicas ex situ e in situ (on farm o en finca). Caracterizar y evaluar las diferentes colecciones de germoplasma en condiciones ex situ e in situ (on farm). Documentar la información proveniente de estudios de las colecciones de germoplasma y on farm. Promover la utilización sostenible de la riqueza genética conservada.